Les pagodes sont caractéristiques de la période d'Asuka (593-710), et furent introduites par les moines bouddhistes. Placées à l’extérieur des temples, elles contribuaient à la spiritualité de l’atmosphère du jardin japonais.

On les retrouvera au même emplacement que les lanternes japonaises, bien souvent à côté d’un point d’eau, où elles apprécieront d’être placées au pied d’un rocher.